最近アップデート多いですね。そんな中Java環境もアップデートされました。セキュリティ云々と関係があるのかどうかはよくわかりませんけど、互換性を気にする必要でもなければ、無条件でアップしときましょう。

リリースノートは以下の通りです。

Java 1.4.2 Update 2 によって、Safari でのアプレット動作の改良、デスクトップ Java アプリケーションの安定性の向上などが行われます。Java 1.4.2 Update 2 には、Java 1.4.2 Update 1 でのすべての改良が含まれます。

現在の Java 環境は Java 1.4.2 Update 2 にアップデートされます。現在のシステムに存在している Java 1.4.1 は、削除されます。以前にインストールされた Java 1.4.2 は、完全に置き換えられます。

このアップデートの詳細については、こちらを参照してください：
http://www.apple.co.jp/java/